皮卡丘已经将自己认为是火箭队的一员，面对大针蜂的袭击、面对食物分享问题，皮卡丘都对喵喵挺不错的，还将苹果分开一半给喵喵，两只宝可梦赶路回去的时候，遇到很多情况，都是相互帮助的。

有时候，喵喵都差点被皮卡丘给攻略的。

现在的皮卡丘多少是受到了小智的影响，以前可是很叛逆的.......大木博士看着白光幕里边的皮卡丘跟喵喵之间的友好相处。

不久，回到火箭队的秘密小屋，武藏跟小次郎得知了皮卡丘失忆，便跟喵喵一起哄骗它，小次郎还让皮卡丘趴在他的肩膀上，一时间小次郎还有点承受不住。

果然是超级真新人，皮卡丘趴在肩膀上都跟没事一样.....众人心想。

经过大王燕跟水跃鱼的寻找后，小智一行人终于是找到了皮卡丘，但皮卡丘就被火箭队三人组给忽悠了，误以为小智是过来抓它的坏人，听从火箭队的指令对小智发出十万伏特。

但小智依旧是上去要带回皮卡丘，连宝可梦都放出来，因为不忍心。

火箭队利用热气球逃跑，小智直接爬上去，他是不可能放弃皮卡丘的。

因为皮卡丘的十万伏特导致整个热气球爆炸，小智保护皮卡丘掉下了河里，一醒来就发现皮卡丘恢复了记忆。

火箭队三人组也掉下来，最后吃了皮卡丘的十万伏特之后，全都被飞了。

找回了皮卡丘之后，小智一行人终于是来到了水静市。

小遥要参加这里的宝可梦华丽大赛，因此结识了名为加奈的女孩，还跟着学习做能量方块，而小智在让大王燕学习燕返的时候，认识了一位老爷爷，他是专门教授飞行宝可梦学习这个燕返招式的，还有专属练习燕返的练习场。

到了第二天的宝可梦华丽大赛，小遥跟力壮鸡惊险的拿下了这一场比赛，差点输给了加奈的噗噗猪，幸好小遥危机时刻灵机一动，利用火焰旋涡破解精神干扰，最后还救下了噗噗猪，不仅拿下了比赛，还赢得了夸奖。

对手也是心服口服。

旅行经过了很多地方，而火箭队三人组也是经常出来捣乱，还是为了能够捕捉皮卡丘。

这不，他们偷偷在船上用网捕捉皮卡丘，但最后又是全部一起被皮卡丘的十万伏特给命中，火箭队三人组是被电飞了，但他们也不好受，一样被电飞。

最后他们意外的进入了熔岩队的潜水艇，从而得知了熔岩队的计划，原来两边人都是为了阻碍对方的计划，分别将对方所要唤醒的传说中宝可梦给关了起来。

熔岩队捕捉盖欧卡，而熔岩队则是要捕捉固拉多，现在双方都没办法，互相拥有了彼此都无法控制的宝可梦。

他们所得到了蓝色宝珠只能控制固拉多，红色宝珠只能控制盖欧卡，双方都准备要交易宝珠，正在前往莫斯岛相约会面，而阿渡出来破坏这个计划，意外发现了小智，但珠子却是钻进了皮卡丘体内！