九月，南陈将军湛文彻侵犯隋朝的和州，隋仪同三司费宝首出击将他擒获。
冬季，十月壬辰日，隋朝任命上柱国杨素为信州总管。
起初，北地人傅縡以庶子的身份在东宫侍奉南陈后主，后主即位后，傅縡升任秘书监、右卫将军兼中书通事舍人。他恃才傲物，搞得很多人都非常怨恨他。施文庆、沈客卿一起诬陷傅縡收受高丽使者的黄金，后主将傅縡逮捕入狱。
傅縡在狱中上书说：“统治百姓的君主，应恭敬侍奉上天，像爱护子女一样爱护百姓，减少嗜欲，远离谄媚奸佞之徒，天不亮就操劳到夜晚，太阳落山了还忘记吃饭，这样才能恩泽遍及天下，福运流传子孙。陛下近来酒色过度，不虔诚祭祀郊庙大神，专门媚事淫乱昏邪的鬼神，小人在身边，宦官玩弄权柄。厌恶忠直之士如同仇敌，看待百姓如同草芥。后宫妃嫔穿着绮罗锦绣，马厩里的马剩下的饲料吃不完，而百姓流离失所，尸体遮蔽荒野，贿赂公然进行，国库资财损耗殆尽。天神愤怒，百姓怨恨，众叛亲离，我担心东南的帝王之气从此断绝。”
奏书呈上后，后主大怒。过了一会儿，怒气稍有缓解，派使者对傅縡说：“我想赦免你，你能改过吗？”傅縡回答说：“我的心就像我的脸，我的脸能改变，我的心才能改变。”后主更加愤怒，命令宦官李善庆彻底追查他的案子，最终将傅縡赐死在狱中。
后主每次举行郊祀典礼，常称病不去，所以傅縡的奏书提到了这件事。这一年，后梁大将军戚昕率领水军袭击南陈的公安城，未能攻克而返回。
隋文帝征召后梁国主的叔父、太尉吴王萧岑入朝，任命他为大将军，封怀义公，趁机将他留在长安不让返回；又设置江陵总管来监视后梁。
后梁大将军许世武秘密联络南陈荆州刺史宜黄侯陈慧纪，想献城归降；计谋泄露，后梁国主将他杀死。陈慧纪是南陈高祖的堂孙。
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隋文帝派司农少卿崔仲方征发三万名壮丁，在朔方、灵武修筑长城，东到黄河，西至绥州，绵延七百里，用来遏制胡人的侵扰。
公元586年二月，隋朝开始下令各州刺史、高级佐官每年年末轮流入朝，接受朝廷考核。丁亥日，隋朝再次命令崔仲方征发十五万壮丁，在朔方以东、沿边险要地带修筑数十座城池。丙申日，南陈后主立皇弟陈叔谟为巴东王，陈叔显为临江王，陈叔坦为新会王，陈叔隆为新宁王。
三月己未日，洛阳男子高德上书，请求隋文帝退位做太上皇，传位给皇太子。隋文帝说：“我承受天命，抚育百姓，每天忙到日落还勤勉不倦，尚且担心做得不够好。怎能效仿近代帝王，把皇位传给儿子，自己追求安逸享乐呢！”
八月戊申日，隋朝申明公李穆去世，朝廷用特殊礼仪安葬他。闰月丁卯日，隋朝太子杨勇出镇洛阳。
隋朝上柱国郕公梁士彦讨伐尉迟迥时，所到之处战无不胜，后来接替尉迟迥担任相州刺史。隋文帝猜忌他，将他召回长安。上柱国杞公宇文忻与隋文帝年轻时交情深厚，擅长用兵，有威名，隋文帝也猜忌他，借故免去他的官职。梁士彦、宇文忻与柱国舒公刘昉都被疏远，闲居无事，心怀怨恨，多次往来密谋叛乱。
宇文忻想让梁士彦在蒲州起兵，自己做内应，梁士彦的外甥裴通参与了谋划并告发了他们。隋文帝隐瞒此事，任命梁士彦为晋州刺史，想观察他的意图；梁士彦很高兴，对刘昉等人说：“这是天意！”他又请求任命仪同三司薛摩儿为长史，隋文帝也答应了。后来在公卿朝见时，隋文帝命令侍卫在行列中逮捕了梁士彦、宇文忻、刘昉。审讯时，三人起初还不认罪。恰逢薛摩儿被抓来，隋文帝命他当庭对质，薛摩儿详细供述了始末，梁士彦脸色大变，对薛摩儿说：“你害死我了！”丙子日，梁士彦、宇文忻、刘昉都被处死，他们的叔侄、兄弟被免死但除去官籍。
九月辛巳日，隋文帝身穿素服亲临射殿，命令百官射取三家的家产物资，以此作为告诫。
冬季，十月己酉日，隋朝任命兵部尚书杨尚希为礼部尚书。隋文帝每天清晨临朝听政，直到日落都不倦怠，杨尚希劝谏说：“周文王因忧虑辛劳减损寿命，周武王因安乐而延长年寿。希望陛下把握大纲，责成宰相处理事务。繁琐细碎的政务，不是君主应该亲自处理的。”隋文帝认为他说得对，但没能听从。
癸丑日，隋朝在襄州设置山南道行台，任命秦王杨俊为尚书令。杨俊的王妃崔氏生下男孩，隋文帝很高兴，赏赐群臣。
直秘书内省博陵人李文博，家境一向贫寒，有人去祝贺他，李文博说：“赏罚的设立，是依据功过。现在王妃生了男孩，和群臣有什么关系，竟胡乱接受赏赐！”听到的人都感到羞愧。
吐谷浑可汗夸吕在位百年，多次因喜怒无常废黜或诛杀太子。后来太子害怕，密谋劫持夸吕归降隋朝，向隋朝边境官吏请求援兵，秦州总管河间王杨弘请求出兵接应，隋文帝没有同意。太子的计谋泄露，被夸吕杀死，夸吕又立小儿子嵬王诃为太子。叠州刺史杜粲请求趁吐谷浑内乱讨伐它，隋文帝又没同意。
这一年，嵬王诃再次害怕被诛杀，密谋率领一万五千户部落归降隋朝，派使者到朝廷请求援兵接应。隋文帝说：“吐谷浑的风俗，与人伦常理不同，父亲既不慈爱，儿子又不孝顺。我用德行教化百姓，怎能助成他们的叛逆恶行呢！”于是对使者说：“父亲有过失，儿子应当劝谏，怎能暗中谋划非法之事，背负不孝的名声！天下都是我的臣民，各自做善事，才符合我的心意。嵬王既然想归顺我，我只教他做臣子的礼法，不能远派兵马帮助他做坏事！”嵬王诃于是停止了计划。
公元587年二月，隋朝征发十万多壮丁修筑长城，二十天后停工。夏季四月，在扬州开凿山阳渎以通漕运。
突厥沙钵略可汗派儿子向隋朝进贡，并请求在恒州、代州之间打猎，隋文帝同意了，还派人赏赐酒食。沙钵略率领部落叩拜两次接受赏赐。
沙钵略不久后去世，隋朝为此停止朝会三天，派太常寺官员前去吊唁祭祀。
起初，沙钵略因儿子雍虞闾懦弱，留下遗命立弟弟叶护处罗侯为可汗。雍虞闾派使者迎接处罗侯，准备拥立他，处罗侯说：“我突厥自木杵可汗以来，多是弟弟取代哥哥，庶子夺取嫡子的位置，违背了先祖的法度，导致互不敬畏。你应当继位，我不怕拜你！”雍虞闾说：“叔父和我父亲是同根连体，我是枝叶，怎能让根本服从枝叶，叔父屈居于晚辈之下呢！况且先父的遗命，怎能废弃！希望叔父不要怀疑！”双方使者相互推让五六次，处罗侯最终继位，这就是莫何可汗。他任命雍虞闾为叶护，派使者向隋朝上奏表说明情况。
隋朝派车骑将军长孙晟持符节册封莫何可汗，赏赐鼓吹、幡旗。莫何可汗勇敢且有谋略，用隋朝所赐的旗鼓向西攻打阿波可汗；阿波的部众以为莫何得到了隋军援助，大多望风归降。莫何最终生擒阿波，上书隋朝请求决定他的生死。
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隋文帝让群臣商议，乐安公元谐请求将阿波就地斩首；武阳公李充请求将他活捉到朝廷，公开处死以示众。隋文帝问长孙晟：“你怎么看？”长孙晟回答说：“如果突厥背叛朝廷，必须用刑罚制裁。现在是他们兄弟自相残杀，阿波的恶行并非针对我国。趁他困窘将他诛杀，恐怕不是招抚远方的办法。不如让他们共存。”左仆射高颎说：“骨肉相残是教化的弊端，应当保全抚养以示宽大。”隋文帝采纳了他们的建议。
八月，隋文帝征召后梁国主入朝。后梁国主率领群臣二百多人从江陵出发；庚申日，抵达长安。
隋文帝因后梁国主在外地，便派武乡公崔弘度率军驻守江陵。军队到达都州时，后梁国主的叔父太傅安平王萧岩、弟弟荆州刺史义兴王萧献等人担心崔弘度袭击他们，乙丑日，派都官尚书沈君公到南陈荆州刺史宜黄侯陈慧纪处请求归降。九月庚寅日，陈慧纪率军抵达江陵城下。辛卯日，萧岩等人驱赶文武官员、百姓共十万人前来投奔南陈。
隋文帝得知后，废除后梁国；派尚书左仆射高颎安抚遗民；为后梁中宗、世宗各安排十户人家守墓；任命后梁国主萧琮为上柱国，赐爵莒公。
十一月丙子日，南陈任命萧岩为开府仪同三司、东扬州刺史，萧献为吴州刺史。