临泾镇将郝泚认为临泾地势险要，水草丰美，吐蕃每次入侵，必定会在这个地方驻军，于是他向泾原节度使段佑进言，请求修筑城池。段佑上奏朝廷之后，便动工修筑临泾城。从此以后，泾原地区得以安定。
二月戊寅日，咸安大长公主在回鹘去世。三月，回鹘腾里可汗去世。癸巳日，郇王李总去世。
辛亥日，御史中丞卢坦上奏弹劾前山南西道节度使柳晟、前浙东观察使阎济美，称他们违反大赦诏令，向朝廷进献财物。宪宗召见卢坦，对他加以褒奖慰问，说：“我已经赦免了他们的罪责，不能失信于人。”卢坦说：“赦令宣告于天下，是陛下的大信。柳晟等人不畏惧陛下的法令，陛下怎么能为了顾全小信，而违背大信呢！”宪宗于是下令，让柳晟、阎济美将进献的财物归还给有关部门。
夏季四月，宪宗下诏举行贤良方正直言极谏科的科举考试。伊阙县尉牛僧孺、陆浑县尉皇甫湜、前科进士李宗闵，在对策中都直言指陈时政的过失，毫无避讳。户部侍郎杨於陵、吏部员外郎韦贯之担任主考官，韦贯之将他们的对策评定为上等。宪宗也对他们的表现表示赞赏。乙丑日，宪宗下诏，命令中书省对他们从优安排官职。李吉甫厌恶他们直言时政，向宪宗哭诉，还说：“翰林学士裴垍、王涯负责复核对策。皇甫湜是王涯的外甥，王涯事先没有说明这层关系；裴垍在复核时也没有提出异议。”宪宗迫不得已，罢免了裴垍、王涯的翰林学士职务，任命裴垍为户部侍郎，王涯为都官员外郎，韦贯之为果州刺史。没过几天，韦贯之又被贬为巴州刺史，王涯被贬为虢州司马。乙亥日，朝廷任命杨於陵为岭南节度使，他也因为在主持科举考试时没有提出异议而受到牵连。牛僧孺等人过了很久都没有得到调任，分别接受各藩镇的征聘，担任幕僚。牛僧孺是牛弘的七世孙；李宗闵是李元懿的玄孙；韦贯之是韦福嗣的六世孙；皇甫湜是睦州新安人。
丁丑日，朝廷废除了五月初一在宣政殿举行朝贺的制度。
朝廷任命荆南节度使裴均为右仆射。裴均向来依附宦官，才得以显贵。担任右仆射之后，他更加骄矜自大。有一次入朝时，他超越了自己的位次站立；御史中丞卢坦向他作揖，示意他退回原位，裴均却拒不从命。卢坦说：“从前姚南仲担任仆射时，位次就在这里。”裴均说：“姚南仲是什么人？”卢坦说：“是坚守正道，不攀附权贵宠臣的人。”不久之后，卢坦便被改任为右庶子。
五月，翰林学士、左拾遗白居易上奏疏，认为：“牛僧孺等人直言时政，承蒙陛下恩宠，考中科举，却反而遭到贬斥，都被外放为京城之外的官员。杨於陵等人因为主持科举考试，敢于录取直言进谏的人；裴垍等人因为复核对策，没有斥退直言进谏的人，都因此受到牵连而被贬谪。卢坦因为屡次履行御史的职责，也被罢黜为右庶子。这几个人都是当今众望所归的人物，天下人都通过观察他们的进退，来判断时势的好坏。如今他们无缘无故都被疏远弃用，朝野上下都闭口不言，民心骚动不安，陛下是否知道这种情况呢！况且陛下既然下诏征召直言极谏的士人，牛僧孺等人的对策既然如此，就算不能将他们的建议推广施行，又怎么忍心加罪于他们，将他们贬斥呢！从前德宗皇帝刚刚即位时，也征召过直言极谏的士人，在策问中提到天旱的问题，穆质回答说：‘按照两汉的惯例，三公应当被罢免；根据卜式的主张，桑弘羊应该被烹杀。’德宗皇帝对他大加赞赏，将他从京城郊县的县尉提拔为左补阙。如今牛僧孺等人所说的话，并没有超过穆质，陛下却急于贬斥他们，我担心这不符合继承祖宗基业的道理啊！”穆质是穆宁的儿子。
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丙午日，朝廷册封回鹘的新任可汗为爱登里啰汨密施合毘伽保义可汗。西原蛮的酋长黄少卿请求归降朝廷。六月癸亥日，朝廷任命黄少卿为归顺州刺史。
沙陀族的勇猛矫健，在各蛮族中位居首位。吐蕃将沙陀人安置在甘州，每次作战时，都让沙陀人担任先锋。回鹘攻打吐蕃，攻取了凉州。吐蕃怀疑沙陀人暗中归附回鹘，想要将他们迁徙到黄河以西的地区。沙陀人十分恐惧，酋长朱邪尽忠和他的儿子朱邪执宜谋划，想要重新归附唐朝。于是朱邪尽忠率领整个部落三万人，沿着乌德犍山向东迁徙。走了三天之后，吐蕃的大批追兵赶到，沙陀人从洮水一带转战到石门，总共经历了数百次战斗。朱邪尽忠战死，士兵们阵亡大半。朱邪执宜率领剩余的部众将近一万人，其中骑兵三千人，前往灵州投降。灵盐节度使范希朝得知此事后，亲自率领部众到边塞迎接，将沙陀人安置在盐州，还为他们购买牛羊，扩大他们的畜牧规模，对他们抚慰有加。朝廷下诏设置阴山府，任命朱邪执宜为兵马使。不久之后，朱邪尽忠的弟弟葛勒阿波又率领七百部众前来投奔范希朝，朝廷下诏任命他为阴山府都督。从此以后，灵盐地区每次出兵征讨，只要调用沙陀军队，无不所向披靡，灵盐军的势力也因此日益强盛。
秋季七月辛巳日，出现日食。
朝廷任命右庶子卢坦为宣歙观察使。苏强被诛杀的时候，他的哥哥苏弘正在晋州幕府任职，苏弘自行离职回家，当时没有人敢征召他。卢坦上奏说：“苏弘有才干德行，不能因为他弟弟的缘故就废弃不用，请求征召他担任判官。”宪宗说：“假如苏强没有被处死，只要他确实有才干德行，尚且可以任用，更何况是他的哥哥呢！”卢坦到任之后，恰逢当地发生旱灾，粮食歉收，粮价日益上涨。有人请求压低粮价，卢坦说：“宣州、歙州土地狭小，粮食产量少，所依赖的是从四面八方运来的粮食。如果粮价降低，商船就不会再运来粮食，百姓的处境会更加窘迫。”不久之后，一斗米的价格涨到了二百钱，各地的商人都纷纷运粮前来，百姓也因此得以生存。
九月庚寅日，朝廷任命于頔为司空，依旧担任同平章事；加封右仆射裴均为同平章事，充任山南东道节度使。淮南节度使王锷入朝觐见。王锷家境极其富裕，他用丰厚的财物进献朝廷，并且贿赂宦官，请求担任同平章事。翰林学士白居易上奏说：“宰相是臣子的最高职位，不是有崇高声望和卓着功勋的人，不应该授予。前不久任命裴均为宰相，外界的议论已经沸沸扬扬，现在又要任命王锷为宰相，那么像王锷这样的人都会产生非分之想。如果把宰相职位都授予这些人，就会严重败坏朝廷的典章制度，而且他们也不会感激陛下的恩德；如果不授予他们，就会显得厚薄不均，有的人还会心生怨恨。侥幸之门一旦打开，后果将不堪设想。况且王锷在淮南任职五年，用尽各种手段搜刮民财，积蓄了充足的财物之后，才亲自入朝进献。如果任命他为宰相，天下的藩镇节度使都会认为王锷是因为进献财物才得到宰相职位，就会争相搜刮百姓，那么百姓怎么能够承受呢！”于是这件事便搁置了下来。
壬辰日，朝廷加封宣武节度使韩弘为同平章事。
丙申日，朝廷任命户部侍郎裴垍为中书侍郎、同平章事。宪宗虽然因为李吉甫的缘故罢免了裴垍的翰林学士职务，但对他的宠信却更加深厚，所以没过多久就将他提拔为宰相。起初，德宗皇帝不信任宰相，天下的琐碎事务都亲自裁决，因此裴延龄之流才得以掌权。宪宗在做藩王的时候，内心就对此不以为然。等到即位之后，他选拔任用宰相，推心置腹地委托他们处理政务，曾经对裴垍等人说：“凭借太宗、玄宗皇帝的英明，尚且需要依靠宰相的辅佐，才能实现天下大治，更何况我这样的人，远远比不上先圣呢！”裴垍也竭诚辅佐宪宗。宪宗曾经问裴垍：“治理国家的关键，首先应该做什么？”裴垍回答说：“首先应该端正君主的心志。”按照旧有的制度，百姓缴纳的赋税分为三部分：一部分上缴朝廷，称为上供；一部分送交节度使，称为送使；一部分留在本州，称为留州。建中初年制定两税法的时候，商品昂贵，钱币便宜。从那以后，商品价格降低，钱币价值增高，百姓所缴纳的赋税，已经比最初增加了一倍。那些留在本州、送交节度使的赋税，各地又降低了官方的估价，按照实际的市价折算，以此加重对百姓的搜刮。等到裴垍担任宰相之后，上奏说：“天下留在本州、送交节度使的财物，请求一律按照官方估价折算。各观察使的经费，先从自己治理的州府收取，不够的话，才允许向所属的其他州府收取。”从此以后，江淮地区的百姓才逐渐得到休养生息。在此之前，官员们进行考核，大多流于形式，粉饰太平，只有裴垍一人注重考察官员的实际政绩。裴垍的器量严谨庄重，人们不敢用私事来请托他。曾经有一位老朋友从远方前来拜访他，裴垍送给对方丰厚的礼物，款待得十分热情。这个人趁机请求裴垍任命自己为京兆府判司，裴垍说：“你的才能不适合担任这个官职，我不敢因为老朋友的私情，而损害朝廷的公正。以后如果有不辨是非的宰相怜惜你，或许你能得到这个职位，但我绝对不可以这么做。”
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戊戌日，朝廷任命中书侍郎、同平章事李吉甫为同平章事，充任淮南节度使。河中、晋绛节度使、邠宣公社黄裳去世。
冬季十二月庚戌日，朝廷在临泾设置行原州，任命镇将郝泚为刺史。
南诏王异牟寻去世，他的儿子寻阁劝即位。
元和四年，公元809年春季正月戊子日，简王李遘去世。接着，渤海康王大嵩璘去世，他的儿子大元瑜即位，改年号为永德。
南方发生旱灾，粮食歉收，出现饥荒。庚寅日，宪宗任命左司郎中郑敬等人担任江淮、两浙、荆湖、襄鄂等道宣慰使，前往赈济抚恤灾民。临行之前，宪宗告诫他们说：“我在皇宫之中，使用一匹丝帛，都要登记它的数量，唯独在救济百姓的时候，就不必计较费用了。你们应当明白我的心意，不要效仿潘孟阳那样，只知道饮酒游山。”
给事中李籓在门下省任职，遇到有不合适的制敕，就在黄纸的背面直接批注。门下省的官吏请求他另外连接白纸进行批注，李籓说：“如果这样做，就成了写文书，还叫什么批敕呢！”裴垍举荐李籓，认为他有担任宰相的才能。宪宗认为门下侍郎、同平章事郑絪处事圆滑，只知道迎合取悦，二月丁卯日，罢免郑絪的宰相职务，改任他为太子宾客；提拔李籓为门下侍郎、同平章事。李籓知无不言，宪宗十分器重他。
河东节度使严绶在任九年，军政事务和官员任免，全部由监军李辅光决定，严绶只是拱手听命而已。裴垍将这种情况详细上奏宪宗，请求任命李鄘接替严绶的职务。三月乙酉日，朝廷任命严绶为左仆射，任命凤翔节度使李鄘为河东节度使。
成德节度使王士真去世，他的儿子、副大使王承宗自行担任留后。黄河以北的幽州、成德、魏博三镇，向来相互沿袭，都设置副大使一职，由节度使的嫡长子担任，节度使去世之后，副大使就接替执掌军务。
宪宗因为长期干旱，想要颁布德音，施行恩惠。翰林学士李绛、白居易上奏说：“想要让百姓得到实实在在的恩惠，没有比减免他们的租税更好的办法了。”他们还说：“皇宫之中，供驱使的宫女数量仍然很多，凡事应当节省开支，体恤百姓的疾苦。”又请求“禁止各道官员横征暴敛，以此充作进献朝廷的财物”。还说：“岭南、黔中、福建一带的风俗，常常掳掠良家子女，将他们卖为奴婢，请求陛下严加禁止。”闰三月己酉日，宪宗颁布制书，下令减免天下在押囚犯的刑罚，免除百姓的租税，放出部分宫女，杜绝地方官的进献，禁止掳掠贩卖人口，这些措施都依从了李绛和白居易的请求。己未日，天降大雨。李绛上表祝贺说：“由此可知，在事情发生之前就加以忧虑，才能避免忧患；等到事情发生之后再去忧虑，就无济于事了。”